Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP28Q8NHY6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms