Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPAP2Q8IXW5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms