Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5S9

TMEM144, Transmembrane protein 144, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM144Q7Z5S9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM144Q7Z5S9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM144Q7Z5S9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM144Q7Z5S9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms