Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP6Q6ZN66 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms