Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLRC3Q5JS37 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms