Protein–RNA interactions for Protein: Q5BVD1

TTMP, TPA-induced transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTMPQ5BVD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTMPQ5BVD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTMPQ5BVD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTMPQ5BVD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTMPQ5BVD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms