Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCBQ16143 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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