Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
R3HDM1Q15032 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
R3HDM1Q15032 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
R3HDM1Q15032 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms