Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D2Q14995 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D2Q14995 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D2Q14995 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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