Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BFSP2Q13515 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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