Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKP2Q13309 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP2Q13309 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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