Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 WDR74-216ENST00000544953 796 ntTSL 210.82□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 21.1
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G3BP1Q13283 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 21.1
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G3BP1Q13283 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.944e-6■■■■□ 21.1
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G3BP1Q13283 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-7■■■■□ 20.9
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G3BP1Q13283 ARID1A-217ENST00000637788 3046 nt12.09□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 20.7
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G3BP1Q13283 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 20.7
G3BP1Q13283 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 20.7
G3BP1Q13283 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.467e-10■■■■□ 20.7
G3BP1Q13283 SEC23A-210ENST00000555425 547 ntTSL 55.91□□□□□ -1.467e-10■■■■□ 20.7
G3BP1Q13283 CLTC-214ENST00000585198 477 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-16■■■■□ 20.7
G3BP1Q13283 PELP1-204ENST00000570571 902 ntTSL 320.49■□□□□ 0.877e-11■■■■□ 20.7
G3BP1Q13283 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-11■■■■□ 20.7
G3BP1Q13283 PELP1-210ENST00000573506 415 ntTSL 213.46□□□□□ -0.257e-11■■■■□ 20.7
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G3BP1Q13283 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 54.86□□□□□ -1.637e-11■■■■□ 20.7
G3BP1Q13283 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 PSMA5-205ENST00000491287 225 ntTSL 38.9□□□□□ -0.982e-14■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 SPTAN1-236ENST00000637820 100 ntTSL 5-0.52□□□□□ -2.492e-15■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.875e-7■■■■□ 20.6
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