Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3FQ13275 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3FQ13275 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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