Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1B1Q10567 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1B1Q10567 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1B1Q10567 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms