Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REG3AQ06141 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REG3AQ06141 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REG3AQ06141 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REG3AQ06141 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REG3AQ06141 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms