Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA1Q02410 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APBA1Q02410 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms