Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLTCQ00610 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLTCQ00610 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCQ00610 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms