Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2DP55273 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2DP55273 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKN2DP55273 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2DP55273 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2DP55273 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms