Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATN1P54259 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATN1P54259 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATN1P54259 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATN1P54259 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATN1P54259 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATN1P54259 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATN1P54259 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATN1P54259 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATN1P54259 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATN1P54259 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATN1P54259 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATN1P54259 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATN1P54259 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATN1P54259 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATN1P54259 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATN1P54259 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATN1P54259 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATN1P54259 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATN1P54259 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATN1P54259 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATN1P54259 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATN1P54259 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATN1P54259 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATN1P54259 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATN1P54259 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATN1P54259 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATN1P54259 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATN1P54259 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATN1P54259 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATN1P54259 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATN1P54259 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATN1P54259 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ATN1P54259 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATN1P54259 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATN1P54259 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATN1P54259 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATN1P54259 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATN1P54259 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATN1P54259 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATN1P54259 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATN1P54259 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATN1P54259 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATN1P54259 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATN1P54259 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATN1P54259 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATN1P54259 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATN1P54259 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATN1P54259 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATN1P54259 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATN1P54259 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATN1P54259 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATN1P54259 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATN1P54259 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATN1P54259 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATN1P54259 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATN1P54259 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATN1P54259 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATN1P54259 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATN1P54259 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATN1P54259 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATN1P54259 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATN1P54259 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATN1P54259 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATN1P54259 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATN1P54259 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATN1P54259 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATN1P54259 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATN1P54259 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATN1P54259 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATN1P54259 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATN1P54259 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATN1P54259 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATN1P54259 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATN1P54259 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATN1P54259 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATN1P54259 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATN1P54259 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATN1P54259 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATN1P54259 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATN1P54259 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATN1P54259 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATN1P54259 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATN1P54259 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms