Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSL1P49006 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms