Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN7P41732 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms