Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA7P31268 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA7P31268 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA7P31268 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms