Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND3P30281 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND3P30281 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND3P30281 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND3P30281 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND3P30281 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND3P30281 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND3P30281 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND3P30281 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND3P30281 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND3P30281 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND3P30281 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND3P30281 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND3P30281 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND3P30281 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND3P30281 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND3P30281 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND3P30281 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND3P30281 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND3P30281 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND3P30281 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND3P30281 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND3P30281 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND3P30281 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND3P30281 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND3P30281 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCND3P30281 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCND3P30281 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND3P30281 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND3P30281 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND3P30281 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND3P30281 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND3P30281 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND3P30281 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND3P30281 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND3P30281 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND3P30281 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND3P30281 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND3P30281 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND3P30281 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND3P30281 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND3P30281 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND3P30281 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND3P30281 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND3P30281 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCND3P30281 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCND3P30281 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCND3P30281 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND3P30281 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND3P30281 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND3P30281 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND3P30281 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND3P30281 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND3P30281 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND3P30281 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND3P30281 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND3P30281 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND3P30281 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND3P30281 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND3P30281 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND3P30281 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND3P30281 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND3P30281 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND3P30281 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND3P30281 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND3P30281 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND3P30281 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND3P30281 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND3P30281 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND3P30281 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND3P30281 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND3P30281 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND3P30281 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND3P30281 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCND3P30281 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCND3P30281 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCND3P30281 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCND3P30281 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND3P30281 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms