Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCL3P20749 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCL3P20749 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCL3P20749 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCL3P20749 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCL3P20749 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCL3P20749 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BCL3P20749 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCL3P20749 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCL3P20749 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCL3P20749 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCL3P20749 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCL3P20749 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCL3P20749 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCL3P20749 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCL3P20749 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCL3P20749 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCL3P20749 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCL3P20749 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCL3P20749 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BCL3P20749 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCL3P20749 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCL3P20749 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCL3P20749 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCL3P20749 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCL3P20749 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BCL3P20749 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCL3P20749 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCL3P20749 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCL3P20749 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCL3P20749 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCL3P20749 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCL3P20749 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCL3P20749 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCL3P20749 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BCL3P20749 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCL3P20749 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCL3P20749 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCL3P20749 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCL3P20749 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCL3P20749 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCL3P20749 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCL3P20749 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCL3P20749 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCL3P20749 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCL3P20749 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCL3P20749 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCL3P20749 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCL3P20749 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BCL3P20749 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BCL3P20749 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BCL3P20749 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BCL3P20749 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BCL3P20749 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BCL3P20749 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BCL3P20749 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BCL3P20749 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BCL3P20749 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms