Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN8P19075 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms