Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNB1P11230 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNB1P11230 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms