Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG10L2P0DP72 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms