Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA6AP0CW24 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms