Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00271P0C7V0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00271P0C7V0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms