Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TPM3P06753 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM3P06753 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM3P06753 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM3P06753 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM3P06753 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM3P06753 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM3P06753 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM3P06753 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM3P06753 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM3P06753 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM3P06753 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM3P06753 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM3P06753 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM3P06753 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM3P06753 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM3P06753 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM3P06753 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM3P06753 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM3P06753 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM3P06753 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM3P06753 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM3P06753 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM3P06753 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM3P06753 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TPM3P06753 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM3P06753 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM3P06753 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM3P06753 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM3P06753 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM3P06753 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM3P06753 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM3P06753 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM3P06753 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM3P06753 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM3P06753 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM3P06753 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM3P06753 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM3P06753 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM3P06753 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM3P06753 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM3P06753 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM3P06753 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM3P06753 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM3P06753 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM3P06753 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM3P06753 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM3P06753 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM3P06753 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM3P06753 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM3P06753 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM3P06753 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM3P06753 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM3P06753 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM3P06753 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM3P06753 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM3P06753 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM3P06753 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM3P06753 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM3P06753 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM3P06753 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM3P06753 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms