Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
S1PR4O95977 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms