Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKNO60260 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKNO60260 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKNO60260 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKNO60260 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKNO60260 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKNO60260 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKNO60260 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKNO60260 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKNO60260 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKNO60260 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKNO60260 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKNO60260 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKNO60260 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKNO60260 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKNO60260 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKNO60260 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKNO60260 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKNO60260 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKNO60260 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKNO60260 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKNO60260 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKNO60260 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKNO60260 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKNO60260 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKNO60260 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKNO60260 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKNO60260 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKNO60260 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKNO60260 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKNO60260 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKNO60260 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKNO60260 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKNO60260 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKNO60260 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKNO60260 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKNO60260 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKNO60260 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms