Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRTM2O43300 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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