Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN6O15212 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms