Protein–RNA interactions for Protein: O00422

SAP18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP18O00422 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAP18O00422 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAP18O00422 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAP18O00422 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAP18O00422 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SAP18O00422 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAP18O00422 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP18O00422 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP18O00422 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP18O00422 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP18O00422 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP18O00422 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP18O00422 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP18O00422 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP18O00422 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP18O00422 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP18O00422 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP18O00422 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP18O00422 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP18O00422 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP18O00422 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP18O00422 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP18O00422 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP18O00422 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP18O00422 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP18O00422 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP18O00422 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP18O00422 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP18O00422 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP18O00422 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP18O00422 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP18O00422 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP18O00422 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP18O00422 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP18O00422 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP18O00422 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP18O00422 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP18O00422 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP18O00422 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP18O00422 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP18O00422 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP18O00422 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP18O00422 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP18O00422 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP18O00422 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP18O00422 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAP18O00422 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAP18O00422 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAP18O00422 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAP18O00422 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAP18O00422 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAP18O00422 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP18O00422 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP18O00422 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP18O00422 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP18O00422 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP18O00422 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP18O00422 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP18O00422 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP18O00422 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAP18O00422 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAP18O00422 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP18O00422 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP18O00422 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP18O00422 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP18O00422 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP18O00422 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP18O00422 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP18O00422 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAP18O00422 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAP18O00422 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAP18O00422 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAP18O00422 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAP18O00422 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAP18O00422 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms