Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NACAE9PAV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.3 ms