Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC182A6NF36 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms