Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3GALT2U3KPV4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A3GALT2U3KPV4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms