Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP4B1Q9Y6B7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 342 ms