Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAD54L2Q9Y4B4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
RAD54L2Q9Y4B4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms