Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P9

RABGAP1, Rab GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1Q9Y3P9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABGAP1Q9Y3P9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms