Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC56.57■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC56.56■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.56■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.56■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC56.56■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC56.55■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC56.55■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC56.54■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.54■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC56.53■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.53■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.52■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC56.52■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.52■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.52■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.52■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.52■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.52■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.51■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.51■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.51■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC56.5■■■■■ 6.64
NISCHQ9Y2I1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.49■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC56.49■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.49■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC56.48■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.48■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.47■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC56.47■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC56.47■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC56.46■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC56.46■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC56.46■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC56.45■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.44■■■■■ 6.63
NISCHQ9Y2I1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC56.43■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC56.43■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.43■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC56.42■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC56.42■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC56.42■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.41■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC56.41■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC56.4■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC56.4■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC56.4■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC56.39■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC56.39■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.38■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC56.38■■■■■ 6.62
NISCHQ9Y2I1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC56.37■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.37■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC56.37■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.36■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC56.36■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC56.36■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.35■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.35■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.34■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.34■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC56.34■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC56.34■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC56.34■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.34■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC56.33■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC56.32■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC56.32■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.31■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.31■■■■■ 6.61
NISCHQ9Y2I1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC56.31■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC56.31■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC56.31■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.29■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC56.29■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC56.29■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.28■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC56.28■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.27■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.27■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC56.27■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC56.27■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.27■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC56.26■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC56.26■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC56.26■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
NISCHQ9Y2I1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC56.23■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.23■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.22■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.22■■■■■ 6.59
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