Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUDCQ9Y266 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUDCQ9Y266 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms