Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF6Q9Y252 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms