Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIGD1AQ9Y241 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms