Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNEQ9Y223 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNEQ9Y223 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNEQ9Y223 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms