Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID1Q9ULK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID1Q9ULK0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms