Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB23Q9ULC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms