Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MID2Q9UJV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms