Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLXNA1Q9UIW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLXNA1Q9UIW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms